El Calcolítico, conocido igualmente como la Edad del Cobre, es un periodo de la prehistoria, previo a la Edad del Bronce. En Gilena contamos con un yacimiento de este periodo en la Cueva de Antoniana, donde destacan algunas piezas singulares como una bellota tallada en marfil de elefante africano que es uno de los simbolos del museo.